2004年6月13日、日本経済新聞により近鉄とオリックスの球団合併が、報道され、球団合併を両球団が検討していることが判明。以後、紆余曲折を経て12月1日、オリックスは球団経営の全体的立て直しを目標として、同じパ・リーグの近鉄と合併することとなり、オリックス・バファローズとなった。なお、この時に選手分配ドラフトが開催行なわれ、選手の約半数を新規参入球団東北楽天ゴールデンイーグルスに譲渡している。合併後のオリックス監督には、近鉄・オリックス両球団で監督経験のある仰木彬（1988年～1992年：近鉄監督、1994年～2001年：オリックス監督）が復帰しており、2007年度までの3年間のみ限定措置として、従来からのオリックスの本拠地である兵庫県と、近鉄の本拠地だった大阪府のダブルフランチャイズの形式が採用され、神戸総合運動公園野球場と大阪ドームをダブル本拠地とする。

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